På Kongehøjskolen består mellemtrinnet af årgangene fra 4. -6. klasse fordelt på 3 spor.

Mellemtrinnet har en selvstændig bygning med faglokaler til musik og håndværk & design. Bygningen ligger centralt placeret på skolens matrikel med udgange til både skolegård og grønne områder.
Det tilstræbes, at personalet har deres undervisning alene i afdelingen.